Bilgi toplama ve analizine odaklanarak, biyoenformatik programlar genel olarak öğrencilere biyolojik bilgileri nasıl çalışacağını öğretir. Programlar, bilgisayarlardaki sınıflar, veri sistemleri, toplama yöntemleri ve bilgi analizi ile birlikte çeşitli bilim tabanlı dersler içerebilir.

PhD programına katılabilmek için öğrencilerin genelde yüksek lisans derecesi tamamlamış olmaları istenmektedir. Ek olarak, orjinal akademik araştırmayı içeren bir tez yada bilimsel inceleme program sonunda istenmektedir. Bazı ülkelerde bu bilimsel incelemenin bir panel önünde savunulması istenmektedir.